Trafi har en framträdande roll inom sjöfartsutbildningen.
Verket auditerar de finska sjöfartsläroanstalterna vart femte år. Andra centrala aktörer inom auditeringen är rådet för utbildningsutvärdering och rådet för utvärdering av högskolorna.
Trafi deltar i planeringen, rapporteringen och uppföljningen av auditeringarna. En auditering är åter aktuell. Utvärderingsarbetet inleddes hösten 2011 och sommaren 2012 rapporterar Trafi om resultaten i form av en landsrapport till Internationella sjöfartsoganisationen (IMO) och EU.